A son actif elle compte plus de 30 ans d'expérience dans le domaine du développement international, en particulier en Amérique latine. Mme Agüero a fait partie du personnel professionnel de la Banque interaméricaine de développement, de la Banque mondiale et du Programme des Nations unies pour le développement. Elle a beaucoup travaillé dans les bureaux de ces organisations à Washington, en Uruguay, à Genève, à Bruxelles et à Paris, ainsi que dans leurs bureaux sur le terrain. En tant que chargée de projet, spécialiste sectorielle et conseillère principale au sein de ces organisations, elle a effectué un travail considérable dans le cadre de projets et de programmes dans un certain nombre de domaines différents, plus récemment dans les domaines de la gouvernance, de la réforme de l'État et des relations entre la société civile et le gouvernement. Elle a également acquis une expérience significative dans les relations entre les organisations internationales, les organisations gouvernementales et non gouvernementales, les partenaires nationaux et internationaux et les homologues.

Au début de sa carrière, Mme Agüero a été responsable de la politique commerciale au département du Trésor des États-Unis et assistante de recherche au Centre d'études stratégiques et internationales à Washington, D.C.