Avant de rejoindre l'USIU-A, Margee Ensign a été pendant sept ans présidente de l'Université américaine du Nigeria (AUN). Avant l'AUN, elle a été la 29e présidente de Dickinson. 

Ensign a également été vice-rectrice aux initiatives internationales, doyenne et professeur à la School of International Studies de l'Université du Pacifique (1999-2010), a travaillé au Rwanda et en Ouganda (2003-1999) et a occupé des postes administratifs et professoraux dans les universités de Columbia et de Tulane.

Ensign a reçu en 2011 le prix African Leadership Award in Educational Excellence. En 2015, les femmes de Jama'atu Nasril Islam au Nigeria l'ont récompensée pour sa contribution au leadership, à la philanthropie et à l'éducation des femmes et des filles dans le nord-est du Nigeria. Elle a publié de nombreux ouvrages dont les travaux portent principalement sur les défis du développement international et sur les implications de l'aide au développement. 

Mme Ensign est titulaire d'une licence du New College en Floride et d'un doctorat en économie politique internationale de l'université du Maryland.