Antes de su cargo en la USIU-A, Margee Ensign se desempeñó durante siete años como presidenta de la Universidad Americana de Nigeria (AUN). Antes de AUN, se desempeñó como la 29.ª presidenta de Dickinson.

Ensign también fue rectora asociada de Iniciativas Internacionales, decana y profesora de la Escuela de Estudios Internacionales de la Universidad del Pacífico (1999-2010), trabajó en Ruanda y Uganda (2003-9) y ocupó cargos administrativos y docentes en las universidades de Columbia y Tulane.

Ensign recibió el Premio al Liderazgo Africano en Excelencia Educativa 2011. En 2015, Women of Jama'atu Nasril Islam en Nigeria la reconoció por sus contribuciones al liderazgo, la filantropía y la educación de mujeres y niñas en el noreste de Nigeria. Es una académica que cuenta con numerosas publicaciones cuyo trabajo se centra principalmente en los desafíos del desarrollo internacional, así como en las implicaciones de la asistencia para el desarrollo.

Ensign obtuvo su B.A. de New College en Florida y su Ph.D. en economía política internacional de la Universidad de Maryland.